Khi sầu riêng thiếu nước trong giai đoạn ra hoa hoặc bắt đầu kết trái, cây sẽ có xu hướng thay lá và mọc ngọn mới. Nguyên nhân là do lượng dưỡng chất dự trữ trong thân cây ít, phải cung cấp năng lượng cho lá non, điều này dẫn đến khả năng đậu trái thấp, thậm chí có thể khiến trái rụng hết.
Nếu thiếu nước khi trái đã lớn và cây đang trong quá trình thay lá non khi cùi trái bắt đầu già, cùi sẽ bị nhão. Tình trạng cùi nhão có thể xảy ra không chỉ do mưa nhiều mà còn vì đất khô, khi không có đủ nước tưới.
Nếu sầu riêng lấy quá nhiều dưỡng chất từ thân và lá cây, cây sẽ trở nên yếu, dễ bị chết. Vì vậy, người trồng thường cắt bỏ bớt trái trong năm đầu tiên khi cây mới ra hoa, chỉ để lại một vài trái. Nếu cây không đủ sức khỏe, việc để quá nhiều trái có thể làm cây chết ngay trong những năm đầu.